In questi anni il Piano degli investimenti per il Siep 2003 - 2008 si è confrontato con una realtà in veloce evoluzione di conseguenza le sue azione concrete, sulla base di analisi ed esigenze emerse nel suo periodo di validità, hanno portato allo sviluppo di specifiche e nuove linee di intervento.
Negli aggiornamenti hanno trovato spazio di sviluppo e adeguamento progetti sulle infrastrutture fisiche, come il progetto Ca.B.La. per la cablatura in banda larga del territorio provinciale; progetti sulle infrastrutture applicative, come il progetto I.C.A.R. per la cooperazione interoperativa fra i sistemi informativi delle regioni.
Nel Sesto aggiornamento del maggio 2006 è stata anche introdotta una nuova area di intervento fra gli interventi di sviluppo, specificatamente dedicata a progetti che comportano particolari condizioni di innovazione, ricerca e sperimentazione.
Con il Nono aggiornamento, a tre anni dalla deliberazione del Piano, si è provveduto ad una sua importante modifica, che ha ulteriormente valorizzato alcuni progetti strategici, ma soprattutto ha messo a sistema il criterio stesso di evoluzione del Siep all'insegna dell'interoperabilità e della cooperazione applicativa tra ambiti e amministrazioni, con una particolare attenzione ai modelli organizzativi che governano i processi, e alla costruttiva partecipazione degli attori territoriali, istituzioni - centri di ricerca - imprese, alla realizzazione di sistemi informativi integrati.
Un altro importante momento di riordino si è prodotto nel dicembre 2007 con l'Undicesimo aggiornamento che ha raccolto e formalizzato anche all'interno del SIEP le trasformazioni avvenute nel corso di questa legislatura a seguito di importanti leggi di riordino che stanno tasformando in particolare il contesto istituzionale della pubblica ammninistrazione del Sistema Trentino e quello della ricerca e innovazione.
